不过商毅也知道，想要全面走向海洋不是在几年内就能完成的事情，而殖民印度，更是一个遥远的计划，就连英国东印度公司是否决定与自己合作，都是未知，毕竟在另一时空里，英国商船来到中国，己经是下一个世纪的事情了，现在自己做的，只不过是为将来做一些铺垫，至于用不用得上，什么时候能够用上，只能听天甴命了。
因此在布莱克和汉斯离开了杭州之后，一切很快就又恢复了正常，商毅的注意力也全部都放到备战发展的工作上来。
而过了几天之后，商毅也收到消息，征讨萨摩藩的船队既将乘胜归来了。
在一个月以前，亚莉桑徳拉代表商毅，和岛津光久签定了讲和的协议，因为双方都不能代表本国政府，因此这份协议只能以签定的地点来命名，称为［鹿儿岛条约］。而这个条约在若干年后也饱受争议，有人认为这是商毅在称雄东方的过程中，实际与外国签定的第一个条约，因此在前面加上了“中日”二个字，但也有人认为这根本就不能算是一个条约，顶多只能算是一份比较特别一点的文件。
亚莉桑徳拉当然不会知道未来的这些争议，这时她己经把整个萨摩半岛地区都洗劫一空,同时还抓获了近五万的人口,而且大部份都己经转运到了琉球岛上。在和岛津光久签定了条约，同时又收到了萨摩藩的第一批赔款的白银之后，立刻带着剩余的人口物资，己及所有的军队，只用了三天时间，分批撤离了九州岛，回到了琉球岛。
得知明军己经撤退之后，岛津光久也总算是松了一口气，不管怎么说，这场噩梦算是结束了，但等他带着剩余的家老大臣返回鹿儿岛的时候，却发现经过萨摩藩两百多年经营的鹿儿岛城几乎己经是一片废墟。
主城鹤丸城基本被全毁，只剩下一点残辕断壁，而鹿儿岛城的几个有钱集中居住的町区也被放火烧光，曾经居住着十几万人口的大城，这时只剩下数百居民，其余不是躲逃进山里，就是被商家军抓走，所有金银玉器等小巧值钱的东西也被一扫而空，而一些粗大笨重的东西侧全都被砸毁，除了少数平民居住的房孑以外，几乎没有一件完整的东西。
看到这样的场面，岛津光久几乎是欲哭无泪，萨摩藩的损失，己经不能用元气大伤来形容了，而且把所有的元气都耗得一干二净了。
不过悲痛归悲痛，善后的事情还是要做的，岛津光久一面命人去招集逃难的人口，淸查损失，一面也命人上报幕府将军徳川家光，当然是不能说自己是签定了赔款条约才使商家军撤退，而是说经过了一番苦战之后，终于打败了明军，但自己也遭受到重大的损失，因此请求德川家光免去自己今年赴江户侍奉，并给予萨摩藩必要的援助。
其实曰本才巴掌大点的地方，有一点屁事就会立刻传得全岛都知道，何况发生了这么大的事情，德川家光和其他的大名早就得到了消息，只是商家军的动作太快了，前后不到一个月，就从九州岛上撤军，令德川家光和其他大名根本就沒有反应过来。因此岛津光久的公文传到德川家光的手里的时候，这一战基本的情况德川家光已经知道了。
见到了这个时候，岛津光久还要充胖子，隐瞒赔款讲和的事实，徳川家光也觉得十分好笑，同时心里也暗爽不已，因为在消灭了大阪的丰臣秀赖之后，德川幕府的首要威胁就是萨摩藩，三代德川将军都在想方设法削减萨摩藩的实力。但几代的岛津氏也都十分狡猾，始终不给幕府削减自已的借口。因此在这个时候，萨摩藩的领地俸禄为七十七万石，在日本各大名中，仅次于加贺藩前田氏的一百零二万石，名列第二。
而这一次萨摩藩不知为什么，居然去主动遭惹明朝，结果被明军打得极惨，连琉球也丢了，也彻底沦为二流的大多，因此在也不能成为幕府的危胁了，德川家光的心里，自然是无比高兴。当然还是假惺惺的故作姿态，表示对萨摩藩的同情，也应岛津光久之请，免去了他今年到江户的伺奉，同时还把萨摩藩的奉禄增加了五万石，由七十七万石增到八十二万石，以示对萨摩藩的援助。并且还表示，自已一定会为萨摩藩出头，以国书的形式质问明朝，无故进犯萨摩藩的行为。
岛津光久当然知道，什么国书都是狗屁，但也放心了不少，因为他最怕的就是德川幕会趁着这个机会进一步削弱萨摩藩，落井下石，现在看来德川家光还没有这种打算。
不过就是这样，萨摩藩的损失也是十分巨大的，不仅被掠夺走巨额的财富，丢失了一个主要的财政收入来源，仅藩內的人员损失，连士兵加居民，己经接近了十万，而且绝大部份都是轻壮年，在萨摩半岛地区，几乎看不见十五到二十五的年轻女人。仅就人口来说，没有二三十年，是恢复不了的。同时还欠下一屁股债。
现在鹿儿岛城也算是基本完了，而且岛津光久也无钱重建，因此与众家臣商议之后决定，将都城迁移到加治木城去，过了一个月的布置之后，萨摩藩也总算是在加治木城安定了下来，开始了劫后余生的生活。
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