曼祖基奇在2012年欧洲杯后加盟拜仁，随队夺得一次欧冠冠军、两次德甲冠军、两次德国杯冠军、一次欧洲超级杯冠军和一次世俱杯冠军。效力拜仁两个赛季里，曼祖基奇在德甲赛场出场五十四次打进三十三球，各项赛事则是出场八十八次打进四十八球，展现出极高的进球效率。
但随着何塞普·瓜迪奥拉在2013年夏天入主拜仁后开始尝试无锋阵，曼祖基奇因此一度沦为替补，而随着罗伯特·来万多夫斯基的加盟，曼祖基奇若选择留队将无法获得稳定的出场时间，最终选择离开。
2014年7月10日，拜仁官网宣布曼祖基奇正式加盟马德里竞技足球俱乐部。马竞在其官网宣布，在和床单军团签署一份五年的合同前，曼祖基奇已经通过马竞方面的体检，其转会费达到两千二百万欧元。而曼祖基奇在接受完体检之后继续享受假期，在结束假期来到球队报道后，曼祖基奇正式亮相卡尔德隆球场。
2014-15赛季，曼祖基奇在效力马德里竞技的第一个赛季，便在各项赛事打入二十球，其中西甲联赛十二球，欧冠五球，国王杯两球，西班牙超级杯一球，虽然表现尚可，但是曼祖基奇与主帅迭戈·西蒙尼关系不佳，而西蒙尼对于曼祖基奇在联赛中的发挥也不满意，最终曼祖基奇在马德里竞技效力一个赛季后选择离开。
2015年6月23日，尤文官方宣布正式签下克罗地亚前锋曼祖基奇。双方签约四年，转会费是一千九百万欧元，将分三期支付。根据尤文官网的介绍，曼祖基奇的转会费达到一千九百万欧元，这将分三期支付，2015年8月前，尤文将支付七百万欧元，2016年8月前支付六百万欧元，2017年8月前再度支付尾款六百万欧元。同时该合同中还附加激励条款，曼祖基奇的转会费最多可达到两千一百万欧元。
曼祖基奇是典型的禁区终结者，在禁区内的进球能力强，但这并不意味着只会在禁区内争顶或抢点。
曼祖基奇虽然在场上不显山不露水，但他总是能够在有限的出场时间里取得进球。在人们的印象中，似乎曼祖基奇只是一个“防守型前锋“。但曼祖基奇也是一个毫不逊色的出色射手，效率--毫无疑问是曼祖基奇的一大优势。曼祖基奇在防守中兢兢业业，是高位围抢的第一道防线。比赛中充满战斗精神的曼祖基奇总是不断的和对手纠缠，轻伤不下火线。
曼祖基奇虽然是“团队射手“，但他更多的是为队友制造空当，他自己制造机会的能力并不如罗伯特·来万多夫斯基那么强。拼抢、跑位、拉空当，曼祖基奇就是依靠自己的努力在拜仁站稳了脚跟。出色的头球能力，更是让曼祖基奇在关键时刻屡屡建功。虽然曼祖基奇在对强队的时候有不俗的发挥，但更多的体现在防守上，这让他的印象分大打折扣。对强队的进球较少，已经成为曼祖基奇的一大短板。
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