1857年5月，曾国藩倾全力进攻九江。
曾国藩在军事会议上这样跟他的部将说，九江城高墙厚，易守难攻，城里的太平军也是久经战阵，战力不俗，从兵力上来说，湘军四万对太平军三万，实力相差无几！自古兵家攻城，必拥三到四倍于守城兵力，从这一点说，湘军是不具备攻克九江的可能的。
但凡事不可以定论，当年武昌之役，湘军仅两万众，便攻克了六万太平军镇守的重镇，只要仔细筹划，找准了太平军的缺点，攻克九江还是有可能的。
九江的致命弱点就是他们的主将，伪燕王秦日纲。
此人好大喜功、刚愎自用，又好摆官架子，典型的家长作风。
曾国藩料定，秦日纲必然不会坐守孤城，定会趁着湘军初来乍到、立足未稳之际偷袭，因此密令悍将曾国荃和李续宾各率一枝人马埋伏在小孤山两侧，自己则亲率一枝人马虚张声势，前往九江城下安营扎寨。
当夜，秦日纲不顾林启容等部将的激烈反对，果然率军偷袭，曾国藩按事先计划佯装大败而逃，秦日纲不知是计率大军掩杀，结果在小孤山下惨遭重创，前去偷袭的一万大军只逃回来两千多人。
湘军初战获胜，士气高涨，将九江城四面合围起来，就是水门也以水师严密监视起来，九江城和外界的联系被彻底切断，陷入孤立无援的绝境。曾国荃以一贯的战术，在九江城四周挖掘暂壕，准备以攻克吉安的战术，长期围攻九江，待九江城弹尽粮绝之后自行告破。
秦日纲再度否定林启容等人的建议，太平军紧闭四门，任由湘军在城下闹翻天也相应不理，结果曾国荃环绕九江城的暂壕挖掘完成，形成了一道坚固的封锁线，太平军要想突破这道封锁线已经没有可能了。
到了5月底，九江城里的情势已经十分严峻了，万不得已，秦日纲只得命令周国虞集结了太平军水师，发起了一次自杀式攻击，不求克敌只求逃出一两艘船，向天京求援。结果，周国虞战死，其弟周国贤率残部顺江而下，在安庆又遭受塔齐布部将周公望伏击，最后仅剩十余艘小船逃到天京。
至此，太平军水师已经全军覆灭，千里长江已经不再控制在太平军手里了。
6月初，洪秀全认为西线局势恶化，天京外围松动，不宜再行北伐，遂不顾韦昌辉的极力反对，诏命石达开率北伐军主力南下返回天京，石达开留下石祥祯经略山东、河南，韦俊继续向北进攻，自己亲率一部返回天京。
1857年6月，满清政府终于和英法联军签订塘沽条约，满清赔款九千万两白银，将江宁和上海两地割让给英国，将广州割让给法国，江苏省成为所谓中立省，大清朝不再驻军管理，英法两国在江苏享有一切应得之权力。
塘沽条约签订生效之后，英法联军从塘沽撤军，准备从上海向西进攻太平天国，以从太平天国处挤榨更多的好处。但英法联军刚刚抵达长海，印度就爆发了轰轰烈烈的民族大起义，将大英帝国在远东的大后方闹成一团糟，英国政府紧急命令远征军返回印度，镇压起义，6月中旬，英国远征军从上海撤走，下旬，法国也相继从上海撤军。
6月底，韦昌辉命石达开率师进驻上海，满清政府最大的外贸港口落入太平天国的控制。
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平！
曾国荃愤怒之极，重重一拳砸在案板上，顿时将已经稍显腐败的案桌从中间砸成两截。
“太气人了！是可忍熟不可忍！大哥，我即刻率吉字营回师长沙，将秦汉这狗日的抓来！什么东西？无故截我两尊火炮不说，居然还敢凭一句话断了湘军的饷银供给！”
“老九！你冷静些。”曾国藩有些不悦地瞪着曾国荃，如今这九弟是出息了，带兵打仗都不含糊，已经替朝廷立下了赫赫战功，唯一令曾国藩有些不爽的是这九弟的脾气也是日渐见长，长此以往，只怕连他这个大哥也压他不住了。
“湘军是朝廷的军队，可长沙卫戍第一师也是朝廷的军队，都是朝廷的军队怎能自相残杀？不像话！”
“他的长沙卫戍第一师是谁封的？他经过大哥你的同意了吗？秦汉他只是个湖广提督，得受大哥你的节制啊？如果大清朝的每个提督都私自扩军，组建什么什么师，那岂非要天下大乱了？”
“九弟，话可不是这样说。”曾国华不乐意道，“长沙卫戍第一师其实就是长沙协，无非只是换了个名字而已！还是一码事嘛。”
“换名儿也不行！”曾国荃厉声道，“长沙协才多少人，撑死了两千人，可这个卫戍师得多少人？将近两万人哪！有我们湘军在前面顶着，湖广地区安如泰山，长沙城用得着那么多官军去把守吗？秦汉他这是想干什么？没经过朝廷和上司的允许，就私自扩军，简直就是造反！”
“老九，闭嘴。”曾国藩拉下脸来，狠狠地瞪了九弟一眼。
“总之，老三你给我转告秦汉那狗东西，十天之内不把两尊火炮以及十万两银子送到吉字营，我要他好看！哼！”
曾国荃闷哼一声，拂袖而去。
曾国华道：“九弟他这是干什么嘛？怎么有气冲自家兄弟来了？”
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